鹿茸的价格较为昂贵，内含丰富的蛋白质、糖分及其他营养成分，贮存稍有不慎，极易发生虫蛀、霉烂和变质，轻则降低药效，重则失去药用价值。因此必须妥善保管贮存。没有干透或是受了潮的鹿茸，会受虫蛀，使质地变轻，残缺不全。若保管得法，就可避免这种现象．减少不必要的损失。
一般的家庭以密封法最好。具体做法是将鹿茸用细布包好，放入樟木箱或皮箱内密封，置阴凉干燥处密闭保存，以保持其持有的腥气，最好拌入少量花椒以防虹，如是鹿茸粉应用瓷瓶盛装。本品易生虫，可贮存于石灰缸中或经常翻晒，里面可放人少量石灰块作为干燥剂。要注意的是鹿茸在密封以前，其本身一定要干燥、无霉烂、无虫蛀。
鹿茸贮存期间，必须做到定期检查。发现虫害及时用磷化铝或嗅甲烷熏杀。
有人喜欢把鹿茸放在冰箱内保存，随用随取，颇为方便。这种方法的优点是不易生虫霉变，缺点是在冰箱且同时装有荤腥、蔬菜等食品，比较潮湿有味，贮放过久，容易使鹿茸的内部质量发生变化，服时可有异昧感。
1．春季或初夏雄鹿长出新角尚未角化时，将角锯下或用快刀砍下，称为锯茸或砍茸。将鹿茸在沸水中略为烫过，晾干，再烫再晾，至积血排尽为度，将鹿茸的茸毛用刀或玻璃刮掉，再用火慢慢烧燎，边燎边刮，最后用清水刷洗茸皮至干净或以瓷片或玻璃片刮净后，置密闭容器放阴凉干燥处保存。
2．将处理好的鹿茸的封口时的结痂，然后把50度(v/v)以上的白酒灌入其中，用毛巾或湿布把整个茸裹严放置一夜，次日鹿茸变软后，用刀具横切，茸片切的越薄越好，摆放在纸上，晾干后防潮湿，保管备用。
3．中药不宜放在冰箱里,药材放入冰箱内，和其他食物混放时间壹长，不但各种细菌容易侵入药材内，而且容易受潮，破坏了药材得药性，所以对壹些贵重得药材，如人参、鹿茸、天麻、党参等，若需长期保存，可放在壹个干净得玻璃瓶内，然后投入适量用文火炒至暗黄得糯米，待晾凉后放入，将瓶盖封严，搁置在阴凉通风处。
4．鹿茸得保存要特别小心，首要得是要注意空气湿度问题，如果空气太潮湿，鹿茸就容易发霉，接着就会生虫。所以首先要把鹿茸放在壹个通风得地方，然后用布包壹些花椒，放在鹿茸旁边，这样就不会招虫了。如果保存得当，三五年内，鹿茸得药效是不会发生变化的。
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